Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm16573-201ENSMUST00000160334 801 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm28728-201ENSMUST00000189087 405 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Pdc-204ENSMUST00000191228 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 0610006L08Rik-202ENSMUST00000206672 803 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 AC110176.1-201ENSMUST00000226219 504 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 AC120347.2-201ENSMUST00000222224 2015 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm23323-201ENSMUST00000104471 133 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Ubash3bQ8BGG7 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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