Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Chil5-203ENSMUST00000200146 1296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r36-204ENSMUST00000220187 504 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp5-203ENSMUST00000108441 3375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Mgat4a-206ENSMUST00000154819 2796 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11920-201ENSMUST00000118491 563 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16726-201ENSMUST00000130184 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Bud31-201ENSMUST00000159018 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm45279-201ENSMUST00000210315 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Snora9-201ENSMUST00000082579 133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 AC125095.1-201ENSMUST00000228387 2020 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Mmp1a-202ENSMUST00000217651 2011 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Sft2d1Q5SSN7 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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