Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Stra6l-202ENSMUST00000107782 4009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tank-205ENSMUST00000112502 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6526-202ENSMUST00000179860 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29605-201ENSMUST00000190800 292 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38303-201ENSMUST00000192603 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45479-201ENSMUST00000211613 802 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 CU024892.1-201ENSMUST00000224869 515 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccndbp1Q3TVC7 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ccndbp1Q3TVC7 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11799-201ENSMUST00000116110 460 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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