Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Zzz3-210ENSMUST00000200570 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm13977-201ENSMUST00000133648 4049 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Mtus1-201ENSMUST00000051379 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Pard3bos2-201ENSMUST00000127498 770 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r171-212ENSMUST00000228674 2488 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r31-203ENSMUST00000177318 2076 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Traf3ip1Q149C2 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms