Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm13156-201ENSMUST00000118348 321 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm4956-202ENSMUST00000178869 672 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Gm37679-201ENSMUST00000192868 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Zfp78-203ENSMUST00000207314 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Olfr303-201ENSMUST00000053958 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Slco1a6-201ENSMUST00000111827 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
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Cntn3Q07409 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Cntn3Q07409 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms