Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm29395-201ENSMUST00000188551 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 5830408C22Rik-203ENSMUST00000210596 326 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Prrx2Q06348 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Tmem56-201ENSMUST00000029777 6248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm21977-201ENSMUST00000163725 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm8068-201ENSMUST00000167440 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm9049-201ENSMUST00000178998 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Prrx2Q06348 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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Prrx2Q06348 Pds5b-202ENSMUST00000038900 7315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 D030068K23Rik-202ENSMUST00000180524 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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Prrx2Q06348 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm15740-201ENSMUST00000159703 1292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Prrx2Q06348 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms