Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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Sh3bp1P55194 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms