Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28547-201ENSMUST00000186357 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm43516-201ENSMUST00000196891 322 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm19719-201ENSMUST00000200934 4230 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr313-202ENSMUST00000217506 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Col25a1-202ENSMUST00000106353 6701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Plec-202ENSMUST00000054449 15018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm45290-201ENSMUST00000211177 3890 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm3669-203ENSMUST00000133259 677 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm14974-202ENSMUST00000150003 677 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm2165-204ENSMUST00000153493 677 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm2101-205ENSMUST00000156730 677 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 B230217J21Rik-201ENSMUST00000218349 3896 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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