Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ctnna3-201ENSMUST00000075099 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Sbf2-205ENSMUST00000164759 7090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr117-202ENSMUST00000213638 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Spata31d1b-201ENSMUST00000165133 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Rcbtb2-209ENSMUST00000164822 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ccdc15-201ENSMUST00000037275 3525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm42907-201ENSMUST00000199793 2148 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Zmym3-203ENSMUST00000117901 5178 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Lrrc32-201ENSMUST00000165205 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mlst8-202ENSMUST00000179163 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ensa-201ENSMUST00000037983 3845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Zscan18-205ENSMUST00000211392 3709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr641-202ENSMUST00000213214 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm27166-201ENSMUST00000184476 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm36952-201ENSMUST00000194923 3625 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pcdh15-241ENSMUST00000195531 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Cdc42bpa-203ENSMUST00000097453 6704 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gprc5c-202ENSMUST00000053361 3667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm5644-201ENSMUST00000122039 465 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm12841-201ENSMUST00000128263 338 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm20767-201ENSMUST00000179071 510 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pfdn5-202ENSMUST00000062492 464 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Tnfrsf22-202ENSMUST00000084396 564 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ndufa9-201ENSMUST00000088194 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Olfr169-202ENSMUST00000215040 2316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 AA986860-201ENSMUST00000039323 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Myh15-201ENSMUST00000168680 6340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ehmt1-201ENSMUST00000046227 4554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Pcdhb7-201ENSMUST00000053037 3501 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Prnd-204ENSMUST00000110172 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mon2-203ENSMUST00000170935 5302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Sp100-202ENSMUST00000066427 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Mill2-206ENSMUST00000228493 2043 ntAPPRIS P4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm19589-201ENSMUST00000189394 2623 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm37522-201ENSMUST00000195437 2884 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gm26896-201ENSMUST00000180482 2526 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Gprin2-203ENSMUST00000226613 10354 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Hoxb4P10284 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms