Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm4808-201ENSMUST00000222283 1203 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 AC151730.1-201ENSMUST00000226106 448 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Dbi-201ENSMUST00000027634 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr16-201ENSMUST00000038432 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Klhl13-202ENSMUST00000115313 3251 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Rnf213-203ENSMUST00000172235 2422 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Fcrl5-204ENSMUST00000193229 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Idh1-203ENSMUST00000169032 2283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm16330-201ENSMUST00000128324 297 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Prh1-203ENSMUST00000177523 993 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Klk1b10-ps-201ENSMUST00000205895 783 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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