Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Fam229b-209ENSMUST00000149949 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 4933404I11Rik-201ENSMUST00000190294 1202 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 4933405O20Rik-201ENSMUST00000119710 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 A930006L05Rik-201ENSMUST00000186821 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms