Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif27-201ENSMUST00000043605 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930511M06Rik-203ENSMUST00000137603 2651 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr348-204ENSMUST00000215199 3557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp8ap2-205ENSMUST00000178925 6557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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