Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm17638-201ENSMUST00000181255 4343 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Hmgxb4-201ENSMUST00000041759 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Olfr417-201ENSMUST00000085862 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Cxcr6-201ENSMUST00000049810 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Shprh-203ENSMUST00000159541 6679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hdac5Q9Z2V6 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Hdac5Q9Z2V6 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm32647-202ENSMUST00000206579 3147 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Ttll4-202ENSMUST00000113678 3762 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Hdac5Q9Z2V6 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm12924-201ENSMUST00000121747 318 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Hdac5Q9Z2V6 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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