Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Fbxw20-201ENSMUST00000079548 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Smg9Q9DB90 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Smg9Q9DB90 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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