Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Olfr1497-201ENSMUST00000061993 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Utrn-205ENSMUST00000218635 11801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm17094-201ENSMUST00000169881 3334 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Agtpbp1-206ENSMUST00000164215 4331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Inpp5d-210ENSMUST00000169754 4937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm15877-201ENSMUST00000121897 964 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Zscan29-202ENSMUST00000110661 5072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Csmd1Q923L3 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms