Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm831-201ENSMUST00000149942 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Sp110-201ENSMUST00000093508 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Pde7a-201ENSMUST00000091314 4454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Map1a-201ENSMUST00000094639 11825 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 1700026D11Rik-203ENSMUST00000144501 535 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Smgc-202ENSMUST00000100293 2878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 A230098N10Rik-202ENSMUST00000200055 356 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Zfp870-201ENSMUST00000178401 5126 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm18313-201ENSMUST00000221036 1784 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms