Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm12661-201ENSMUST00000118780 3335 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm44147-201ENSMUST00000204658 94 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Olfr212-201ENSMUST00000075756 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Onecut2-202ENSMUST00000175965 13391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
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Rpusd2Q149F1 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 9430069I07Rik-201ENSMUST00000179647 336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Rpusd2Q149F1 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
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