Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 AC154618.2-201ENSMUST00000228299 452 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 n-R5s172-201ENSMUST00000104508 114 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Lair1-209ENSMUST00000205296 412 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 AC165292.1-201ENSMUST00000215218 620 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Vmn1r83-201ENSMUST00000086229 996 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 9530036O11Rik-202ENSMUST00000181202 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Igkv5-37-201ENSMUST00000103372 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Gjb2Q00977 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms