Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm13400-201ENSMUST00000117436 380 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm43098-201ENSMUST00000199989 1297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Hoxd13P70217 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm31562-201ENSMUST00000213973 2747 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Lama2-201ENSMUST00000092639 9614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm12442-201ENSMUST00000118372 338 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd13P70217 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms