Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Ipo5-201ENSMUST00000032898 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Il5-201ENSMUST00000048605 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Rps29P62274 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm15331-201ENSMUST00000120225 385 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm6067-201ENSMUST00000121648 491 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm29234-201ENSMUST00000187452 1262 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 4930594C11Rik-201ENSMUST00000192316 2755 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm43857-201ENSMUST00000200343 3079 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Ppp1r1c-201ENSMUST00000040863 629 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pik3c2a-204ENSMUST00000206219 5670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Vmn1r27-202ENSMUST00000226666 2969 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 AC183268.1-201ENSMUST00000215753 2837 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Olfr532-203ENSMUST00000213801 4232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Rps29P62274 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms