Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mllt3-208ENSMUST00000149357 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Svs5-201ENSMUST00000017148 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Speer1-201ENSMUST00000172106 1123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Txn-ps1-201ENSMUST00000186385 309 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm5316-201ENSMUST00000050391 270 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm37535-201ENSMUST00000194442 2365 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tctex1d1-202ENSMUST00000116317 1772 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm33248-201ENSMUST00000205836 617 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
VdrP48281 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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