Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprkP35822 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Kansl1-203ENSMUST00000106971 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm32158-201ENSMUST00000200135 404 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprkP35822 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Sema5a-201ENSMUST00000067458 10809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm42607-201ENSMUST00000200221 3393 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
PtprkP35822 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms