Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr331-201ENSMUST00000081743 975 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ctnnd1-222ENSMUST00000111696 6281 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Dusp3-206ENSMUST00000151678 4084 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Iglc3-201ENSMUST00000200235 452 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Igf1r-201ENSMUST00000005671 11409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Sptlc3-201ENSMUST00000047370 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC107453.1-201ENSMUST00000227490 3268 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Tenm4-201ENSMUST00000107162 11021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Cers4-201ENSMUST00000008350 9475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm10062-201ENSMUST00000072180 1470 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
PtprmP28828 AC159208.1-201ENSMUST00000221403 649 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
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