Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 2700078F05Rik-201ENSMUST00000194331 3244 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14631-201ENSMUST00000119067 594 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Tshb-203ENSMUST00000172026 604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm19480-201ENSMUST00000185547 667 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm35021-202ENSMUST00000210289 961 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Vmn1r11-202ENSMUST00000226968 2522 ntAPPRIS P2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm24462-201ENSMUST00000102430 106 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
PdgfaP20033 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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