Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Toporsl-202ENSMUST00000107671 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45241-201ENSMUST00000211237 634 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC114008.1-201ENSMUST00000226193 937 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 B530045E10Rik-204ENSMUST00000220146 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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