Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm25281-201ENSMUST00000157270 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Oaz3-201ENSMUST00000191506 732 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13739-201ENSMUST00000118020 530 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm12396-201ENSMUST00000121600 306 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 1700022N22Rik-201ENSMUST00000180932 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Pls3-203ENSMUST00000114058 3032 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Mir1960-201ENSMUST00000157488 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm27204-201ENSMUST00000184673 527 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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