Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm26901-201ENSMUST00000181554 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28556-201ENSMUST00000187489 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4933406J09Rik-201ENSMUST00000203352 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6877-201ENSMUST00000119347 1101 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11796-201ENSMUST00000120208 972 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC163667.1-201ENSMUST00000225201 1289 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
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