Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm18655-201ENSMUST00000214802 1090 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC154380.1-201ENSMUST00000226804 720 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Zfp60-201ENSMUST00000042641 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr726-207ENSMUST00000217319 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Ccer1Q9CQL2 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Ccer1Q9CQL2 Gm7502-201ENSMUST00000169235 733 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Ccer1Q9CQL2 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 D3Ertd751e-212ENSMUST00000194346 744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm4247-201ENSMUST00000211441 1042 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Mplkip-202ENSMUST00000221480 582 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC153152.2-201ENSMUST00000223165 959 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 AC165106.1-201ENSMUST00000227580 408 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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