Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm42894-201ENSMUST00000200788 3390 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Ccdc141-202ENSMUST00000049544 8969 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm29377-201ENSMUST00000185892 1161 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm29467-202ENSMUST00000189669 935 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm29633-207ENSMUST00000190523 737 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 A930030B08Rik-201ENSMUST00000207625 3965 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Ccdc18Q640L5 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm11972-201ENSMUST00000118514 389 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Ccdc18Q640L5 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm10220-201ENSMUST00000088236 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ccdc18Q640L5 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Ccdc18Q640L5 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC138221.1-201ENSMUST00000216180 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ktn1-213ENSMUST00000188330 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Ipcef1-203ENSMUST00000105617 6041 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Ccdc18Q640L5 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
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