Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm10767-201ENSMUST00000099412 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ehf-202ENSMUST00000111174 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15366-201ENSMUST00000118433 1019 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Znrd1-203ENSMUST00000172823 454 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm5885-201ENSMUST00000178578 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Cenpe-201ENSMUST00000062893 7910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 9430053O09Rik-201ENSMUST00000192654 2570 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Rfx4-203ENSMUST00000095388 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Shoc2-202ENSMUST00000169861 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim71Q1PSW8 Gm37770-201ENSMUST00000192855 772 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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