Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm26784-201ENSMUST00000181666 410 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm6667-201ENSMUST00000217169 564 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC133598.2-201ENSMUST00000224302 624 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Ep400-201ENSMUST00000041558 10608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm7970-201ENSMUST00000167615 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm8229-201ENSMUST00000168161 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Olfr622-204ENSMUST00000216570 2149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Kcnj15-207ENSMUST00000113861 3385 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Osbpl6-201ENSMUST00000077972 8037 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Tmprss11e-201ENSMUST00000161306 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Hoxb2P0C1T1 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Nolc1-201ENSMUST00000165017 3634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Crem-207ENSMUST00000126578 915 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Hoxb2P0C1T1 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms