Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Crnn-201ENSMUST00000107300 1628 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15048-201ENSMUST00000118201 954 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 D830026I12Rik-201ENSMUST00000124434 935 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Scgb1b17-201ENSMUST00000187081 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Scgb1b10-201ENSMUST00000187257 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Scgb1b15-201ENSMUST00000189118 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm3544-201ENSMUST00000196129 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 4930519F16Rik-201ENSMUST00000033688 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
H2-Eb1P04230 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms