Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm6125-201ENSMUST00000217983 3472 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr984-204ENSMUST00000217536 5114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Dynlt1-ps1-201ENSMUST00000117045 342 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ccl20O89093 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Anxa3-202ENSMUST00000196126 453 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm44053-201ENSMUST00000203364 929 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ccl20O89093 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Morn2-201ENSMUST00000061703 644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr177-201ENSMUST00000072853 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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Ccl20O89093 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Zc2hc1a-201ENSMUST00000051064 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Ccl20O89093 Gm13485-201ENSMUST00000146690 659 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms