Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rian-205ENSMUST00000182100 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm44442-201ENSMUST00000204298 422 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm15500-201ENSMUST00000071523 894 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm45477-201ENSMUST00000200213 5498 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm44102-201ENSMUST00000204031 1666 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Cfap70-201ENSMUST00000022348 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37958-201ENSMUST00000193131 430 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Spink8-201ENSMUST00000118732 637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ccdc180J3QNE4 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 9330178D15Rik-201ENSMUST00000196033 3451 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm9293-201ENSMUST00000223096 306 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc180J3QNE4 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms