Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Sytl5-201ENSMUST00000067529 2301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC022682.2-202ENSMUST00000224394 3943 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm11397-201ENSMUST00000050276 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 4930583P06Rik-201ENSMUST00000136658 706 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1700025B11Rik-201ENSMUST00000190233 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Fam227b-204ENSMUST00000178118 1599 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Zfp607b-202ENSMUST00000120004 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm26606-201ENSMUST00000181292 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Grik3B1AS29 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14457-201ENSMUST00000148069 1161 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm26804-201ENSMUST00000181248 1017 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms