Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Scn3b-203ENSMUST00000171835 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 9230020A06Rik-201ENSMUST00000151841 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm15885-201ENSMUST00000122114 388 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm21839-201ENSMUST00000179536 378 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Krtdap-203ENSMUST00000187493 420 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Krtdap-205ENSMUST00000189673 345 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Krtdap-206ENSMUST00000189962 323 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm31711-201ENSMUST00000220687 196 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm19047-201ENSMUST00000220922 1099 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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Rfc5Q9D0F6 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Trbv29-201ENSMUST00000103281 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm14865-201ENSMUST00000117523 494 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rfc5Q9D0F6 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms