Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Ighv8-2-201ENSMUST00000195037 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 A2m-201ENSMUST00000032203 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Psg20-202ENSMUST00000108482 1871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr1348-210ENSMUST00000214383 2582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mup6-202ENSMUST00000107520 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm23071-201ENSMUST00000158242 115 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm2042-202ENSMUST00000180706 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37430-201ENSMUST00000193039 196 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 2610001J05Rik-201ENSMUST00000139231 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm15715-201ENSMUST00000118032 283 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm13455-201ENSMUST00000118767 517 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms