Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm27507-201ENSMUST00000184199 93 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Scn8a-207ENSMUST00000200959 587 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm43964-201ENSMUST00000203570 301 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 AC151901.1-201ENSMUST00000218274 180 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 CT025667.1-201ENSMUST00000225872 382 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 BC061195-201ENSMUST00000088133 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 1700003E24Rik-201ENSMUST00000088134 577 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ubxn4Q8VCH8 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Med23-202ENSMUST00000092646 5098 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Bmp10-201ENSMUST00000032125 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Itih4-201ENSMUST00000006703 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm13106-201ENSMUST00000119045 1443 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm11758-202ENSMUST00000107327 1325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Rpl5-ps1-201ENSMUST00000121367 894 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm7546-201ENSMUST00000146119 966 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Atxn3-205ENSMUST00000161011 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Gm43057-201ENSMUST00000196789 429 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ubxn4Q8VCH8 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms