Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps13-201ENSMUST00000178365 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps11-201ENSMUST00000178427 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps12-201ENSMUST00000179020 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps17-201ENSMUST00000179067 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps6-201ENSMUST00000179239 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps14-201ENSMUST00000179356 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps18-201ENSMUST00000179420 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12-ps15-201ENSMUST00000179567 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rps12l1-201ENSMUST00000183090 399 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm28358-201ENSMUST00000187860 636 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 AC154573.2-201ENSMUST00000224174 378 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm43128-201ENSMUST00000202212 1621 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gk-208ENSMUST00000156390 4245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Usp27Q8CEG8 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Usp27Q8CEG8 1700120G07Rik-202ENSMUST00000190881 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Usp27Q8CEG8 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Usp27Q8CEG8 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 E330034G19Rik-203ENSMUST00000161740 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Usp27Q8CEG8 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Usp27Q8CEG8 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Usp27Q8CEG8 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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