Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot4-201ENSMUST00000044163 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Trip12-206ENSMUST00000186465 9590 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nlk-ps1-201ENSMUST00000120843 1230 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8159-201ENSMUST00000163738 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8297-201ENSMUST00000171636 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 CT025598.1-201ENSMUST00000225140 427 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r198-204ENSMUST00000227167 5990 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ncf2-202ENSMUST00000186568 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp870-202ENSMUST00000228075 5222 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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