Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Cyld-201ENSMUST00000043526 8022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm44316-201ENSMUST00000199274 97 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Tanc1-208ENSMUST00000139863 7246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Klk1b9-201ENSMUST00000081399 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r51-202ENSMUST00000174204 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 4932415D10Rik-201ENSMUST00000171401 3163 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 4632404H12Rik-202ENSMUST00000195940 4671 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm45117-201ENSMUST00000207250 1774 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarca2Q6DIC0 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm29111-201ENSMUST00000188823 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm28584-201ENSMUST00000191489 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm38138-201ENSMUST00000193274 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm37991-201ENSMUST00000194297 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarca2Q6DIC0 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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