Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps80-201ENSMUST00000174838 966 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm5229-201ENSMUST00000039375 354 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC153152.1-201ENSMUST00000221105 2742 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm5546-201ENSMUST00000056145 2777 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr484-202ENSMUST00000214722 4676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28320-201ENSMUST00000187777 2273 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC136376.1-201ENSMUST00000228496 950 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 3000002C10Rik-203ENSMUST00000144161 3977 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29825-201ENSMUST00000214237 3775 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm36328-201ENSMUST00000204237 432 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Eif2ak4-206ENSMUST00000110874 5298 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Adam22-206ENSMUST00000115386 9056 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Zfp652-202ENSMUST00000107717 10433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm3608-201ENSMUST00000086725 2858 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Shank3Q4ACU6 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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