Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm4835-201ENSMUST00000155839 972 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Klra2-202ENSMUST00000088867 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm12034-201ENSMUST00000119032 399 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm11371-201ENSMUST00000120294 385 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Irx2P81066 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Irx2P81066 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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Irx2P81066 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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Irx2P81066 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm43867-201ENSMUST00000203860 525 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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Irx2P81066 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Reep3-202ENSMUST00000217841 2925 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Gm29506-201ENSMUST00000191045 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Irx2P81066 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms