Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm13417-201ENSMUST00000155475 533 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Zfp87-202ENSMUST00000181341 480 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Cldn18P56857 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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Cldn18P56857 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm36947-201ENSMUST00000194709 2249 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 4933406B17Rik-201ENSMUST00000212602 4333 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Cldn18P56857 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Cldn18P56857 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Cldn18P56857 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Cldn18P56857 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC131187.2-201ENSMUST00000223936 994 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 C030017G13Rik-201ENSMUST00000202959 2331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Cldn18P56857 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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