Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Trappc13-206ENSMUST00000179891 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 AC122371.2-201ENSMUST00000220583 366 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
NcanP55066 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm5868-201ENSMUST00000031124 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Pde4b-204ENSMUST00000106901 2129 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Skil-202ENSMUST00000117728 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Vmn1r8-202ENSMUST00000227706 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Olfr497-202ENSMUST00000213521 2396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
NcanP55066 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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NcanP55066 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Scgb2b27-201ENSMUST00000085620 512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Nmrk1-201ENSMUST00000042392 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
NcanP55066 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NcanP55066 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NcanP55066 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
NcanP55066 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NcanP55066 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
NcanP55066 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
NcanP55066 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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