Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Cd96-201ENSMUST00000023336 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm8715-201ENSMUST00000162728 531 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm44707-201ENSMUST00000206293 1216 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PctpP53808 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PctpP53808 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PctpP53808 Fam26d-201ENSMUST00000048052 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PctpP53808 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PctpP53808 Ms4a18-201ENSMUST00000177684 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PctpP53808 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm15901-201ENSMUST00000117663 941 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm23762-201ENSMUST00000158348 106 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm5853-201ENSMUST00000197183 632 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Mark1-ps2-201ENSMUST00000197823 384 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 1700034P13Rik-206ENSMUST00000207445 1146 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm45486-201ENSMUST00000211767 1109 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Olfr1416-201ENSMUST00000086837 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PctpP53808 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PctpP53808 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PctpP53808 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms