Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 1700111N16Rik-201ENSMUST00000188663 1133 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Myo6-201ENSMUST00000035889 7871 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Dmxl2-201ENSMUST00000118163 10614 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Cep162-201ENSMUST00000093802 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm44737-201ENSMUST00000206950 2355 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gli3-201ENSMUST00000110510 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm28718-201ENSMUST00000188417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Zfp292-202ENSMUST00000098163 9941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mir708-201ENSMUST00000102189 109 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ncor1-201ENSMUST00000018645 9037 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm37107-201ENSMUST00000195326 2552 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Myo15-201ENSMUST00000071880 11769 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Mars2-201ENSMUST00000061334 11294 ntAPPRIS P1 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Prrg1-202ENSMUST00000114025 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm13566-201ENSMUST00000117428 1142 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
PtprmP28828 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
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