Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14783-201ENSMUST00000118900 663 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm22552-201ENSMUST00000157796 337 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Speer6-ps1-201ENSMUST00000168736 545 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Clec12a-201ENSMUST00000065289 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc6D3YZP9 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc6D3YZP9 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm22499-201ENSMUST00000104501 135 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc6D3YZP9 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc6D3YZP9 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc6D3YZP9 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc6D3YZP9 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Ccdc6D3YZP9 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 1700031M16Rik-206ENSMUST00000191037 711 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc6D3YZP9 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms