Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm18995-201ENSMUST00000202981 520 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr716-201ENSMUST00000098137 1104 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC153132.1-201ENSMUST00000222625 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm14912-201ENSMUST00000120166 1773 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11217-201ENSMUST00000141162 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 AC153962.2-202ENSMUST00000219391 1382 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rabgef1Q9JM13 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15056-201ENSMUST00000122025 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rabgef1Q9JM13 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rabgef1Q9JM13 4930563I02Rik-202ENSMUST00000154835 971 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Fbxw7-203ENSMUST00000107678 4073 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Itpr1-205ENSMUST00000203615 9761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 A430110C17Rik-201ENSMUST00000195666 4348 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Gm10256-203ENSMUST00000189964 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rabgef1Q9JM13 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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