Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr376-202ENSMUST00000120401 3342 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Eps15-207ENSMUST00000175776 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC159195.2-201ENSMUST00000223670 3757 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Luzp1-202ENSMUST00000063021 3775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm13490-201ENSMUST00000143870 2409 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-221ENSMUST00000111695 6344 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm34350-201ENSMUST00000208898 481 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Zfp790-202ENSMUST00000178162 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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NipblQ6KCD5 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 F730035P03Rik-201ENSMUST00000065741 917 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr994-201ENSMUST00000099925 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-220ENSMUST00000111694 6362 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43876-201ENSMUST00000203831 3229 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Prg4-208ENSMUST00000164600 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm38124-201ENSMUST00000191710 2581 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Card6-201ENSMUST00000118365 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NipblQ6KCD5 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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